Уровни существования BTN

“Индивидуальный” уровень: отдельная мидия, как биотоп для паразита

“Популяцинный” уровень: поселение мидий, как биотоп для паразита

Индивидуальный уровень

Индивидуальный уровень: Влияние зараженности BTN1 и BTN2 на продукцию гамет

Индивидуальный уровень: Влияние зараженности BTN1 и BTN2 на продукцию гамет

Член модели edf Chi2 p-value
s(Rate_of_aneuploid_cells):BTN_TypeBTN1 1.0 6.23 0.0126
s(Rate_of_aneuploid_cells):BTN_TypeBTN2 1.0 2.51 0.1134
s(Sample) 3.3 3.84 0.2736

Индивидуальный уровень: Влияние зараженности BTN1 и BTN2 на продукцию гамет

Индивидуальный уровень: связь роста с интенсивностью инвазии

Член модели edf Chi2 p-value
s(Last_ring):BTN_TypeBTN1 2.1 11.02 0.0001
s(Last_ring):BTN_TypeBTN2 1.3 7.98 0.0022
s(Rate_of_aneuploid_cells):BTN_TypeBTN1 1.0 3.31 0.0758
s(Rate_of_aneuploid_cells):BTN_TypeBTN2 3.7 2.64 0.0412
s(Sample) 0.0 0.00 0.4321

Индивидуальный уровень: связь роста с интенсивностью инвазии

Индивидуальный уровень: связь роста с присутcтвием BTN разных линий

Популяционный уровень

Имеет ли смысл данный анализ?

Любая связь с тем или иным предиктором будет выражена в связи с ним пространственного варьирования экстенсивности инвазии (встречаемости зараженных мидий).

Если пространственное распределение экстенсивности инвазии случайно, то искать факторы, регулирующие распределение смысла не имеет.

Имеет ли смысл данный анализ?

Введем статистики

  1. Варьирование частот в пределах локации (масштаб нескольких метров) оценивалась, как сумма квадратов отклонений частоты в выборке от среднего значения для данной локации:

\[ SS_{within} = \Sigma\Sigma(p_{i,j} - \overline{p_i})^2 \]

где \(p_{i,j}\) - частота в j-й выборке в i-й локации, \(\overline{p_i}\) - среднее значение частоты для i-й локации.

Имеет ли смысл данный анализ?

Введем статистики

  1. Варьирование частот между локациями (масштаб километров) оценивали, как сумму квадратов отклонений частоты в локации от среднего значения по всем локациям

\[ SS_{between} = \Sigma(p_{i} - \overline{p_{total}})^2 \]

где \(p_{i}\) - частота в i-й локации, \(\overline{p_{total}}\) - среднее значение частоты, для всех локаций.

Случайно ли распределение BTN1 и BTN2?

Можно думать о том, что распределение BTN регулируется некоторыми факторами как на локальном (в масштабах метров), так и на региональном (в масштабах километров) уровне.

Локальный уровень нам пока недоступен для анализа

Предикторы для модели: абиотические

Самый очевидный абиотичесикй фактор - соленость варьирует в очень узких пределах: 7, 30 промилле.

Предикторы для модели: абиотические

Биотические предикторы для модели: Размерная структура

Биотические предикторы для модели: Размерная структура

Биотические предикторы для модели: Размерная структура

Биотические предикторы для модели: Скорость роста (OGP)

Биотические предикторы для модели: Общее обиле мидий в локации (проективное покрытие)

Модель со всеми предикторами

Член модели edf Chi2 p-value
s(Dist_Port):LineageBTN1 0.9 5.74 0.0490
s(Dist_Port):LineageBTN2 0.0 0.00 0.8472
s(fetch):LineageBTN1 1.0 8.37 0.0067
s(fetch):LineageBTN2 0.0 0.00 0.7933
s(Cover):LineageBTN1 0.0 0.00 0.7070
s(Cover):LineageBTN2 0.0 0.00 0.3513
s(PC1):LineageBTN1 0.0 0.00 0.5500
s(PC1):LineageBTN2 0.0 0.00 0.4362
s(PC2):LineageBTN1 1.1 8.89 0.0011
s(PC2):LineageBTN2 0.0 0.00 0.9087
s(OGP_sample):LineageBTN1 0.9 3.36 0.0335
s(OGP_sample):LineageBTN2 0.0 0.00 0.7184
s(Sample) 0.9 8.20 0.0019

Визуализация значимых связей

Проверка предсказательной силы модели

Связь с ключевыми предикторами на данных 2021 г

Fetch

Связь с ключевыми предикторами на данных 2021 г

Расстояние до порта

Связь с ключевыми предикторами на данных 2021 г.

Положение относительно порта

Связь с ключевыми предикторами на данных 2021 г.

Положение относительно порта

Спасибо за внимание!