Уровни существования BTN
“Индивидуальный” уровень: отдельная мидия, как биотоп для паразита
“Популяцинный” уровень: поселение мидий, как биотоп для паразита
Индивидуальный уровень
Индивидуальный уровень: Влияние зараженности BTN1 и BTN2 на продукцию гамет
Индивидуальный уровень: Влияние зараженности BTN1 и BTN2 на продукцию гамет
| Член модели | edf | Chi2 | p-value |
|---|---|---|---|
| s(Rate_of_aneuploid_cells):BTN_TypeBTN1 | 1.0 | 6.23 | 0.0126 |
| s(Rate_of_aneuploid_cells):BTN_TypeBTN2 | 1.0 | 2.51 | 0.1134 |
| s(Sample) | 3.3 | 3.84 | 0.2736 |
Индивидуальный уровень: Влияние зараженности BTN1 и BTN2 на продукцию гамет
Индивидуальный уровень: связь роста с интенсивностью инвазии
| Член модели | edf | Chi2 | p-value |
|---|---|---|---|
| s(Last_ring):BTN_TypeBTN1 | 2.1 | 11.02 | 0.0001 |
| s(Last_ring):BTN_TypeBTN2 | 1.3 | 7.98 | 0.0022 |
| s(Rate_of_aneuploid_cells):BTN_TypeBTN1 | 1.0 | 3.31 | 0.0758 |
| s(Rate_of_aneuploid_cells):BTN_TypeBTN2 | 3.7 | 2.64 | 0.0412 |
| s(Sample) | 0.0 | 0.00 | 0.4321 |
Индивидуальный уровень: связь роста с интенсивностью инвазии
Индивидуальный уровень: связь роста с присутcтвием BTN разных линий
Популяционный уровень
Имеет ли смысл данный анализ?
Любая связь с тем или иным предиктором будет выражена в связи с ним пространственного варьирования экстенсивности инвазии (встречаемости зараженных мидий).
Если пространственное распределение экстенсивности инвазии случайно, то искать факторы, регулирующие распределение смысла не имеет.
Имеет ли смысл данный анализ?
Введем статистики
- Варьирование частот в пределах локации (масштаб нескольких метров) оценивалась, как сумма квадратов отклонений частоты в выборке от среднего значения для данной локации:
\[ SS_{within} = \Sigma\Sigma(p_{i,j} - \overline{p_i})^2 \]
где \(p_{i,j}\) - частота в j-й выборке в i-й локации, \(\overline{p_i}\) - среднее значение частоты для i-й локации.
Имеет ли смысл данный анализ?
Введем статистики
- Варьирование частот между локациями (масштаб километров) оценивали, как сумму квадратов отклонений частоты в локации от среднего значения по всем локациям
\[ SS_{between} = \Sigma(p_{i} - \overline{p_{total}})^2 \]
где \(p_{i}\) - частота в i-й локации, \(\overline{p_{total}}\) - среднее значение частоты, для всех локаций.
Случайно ли распределение BTN1 и BTN2?
Можно думать о том, что распределение BTN регулируется некоторыми факторами как на локальном (в масштабах метров), так и на региональном (в масштабах километров) уровне.
Локальный уровень нам пока недоступен для анализа
Предикторы для модели: абиотические
Самый очевидный абиотичесикй фактор - соленость варьирует в очень узких пределах: 7, 30 промилле.
Предикторы для модели: абиотические
Биотические предикторы для модели: Размерная структура
Биотические предикторы для модели: Размерная структура
Биотические предикторы для модели: Размерная структура
Биотические предикторы для модели: Скорость роста (OGP)
Биотические предикторы для модели: Общее обиле мидий в локации (проективное покрытие)
Модель со всеми предикторами
| Член модели | edf | Chi2 | p-value |
|---|---|---|---|
| s(Dist_Port):LineageBTN1 | 0.9 | 5.74 | 0.0490 |
| s(Dist_Port):LineageBTN2 | 0.0 | 0.00 | 0.8472 |
| s(fetch):LineageBTN1 | 1.0 | 8.37 | 0.0067 |
| s(fetch):LineageBTN2 | 0.0 | 0.00 | 0.7933 |
| s(Cover):LineageBTN1 | 0.0 | 0.00 | 0.7070 |
| s(Cover):LineageBTN2 | 0.0 | 0.00 | 0.3513 |
| s(PC1):LineageBTN1 | 0.0 | 0.00 | 0.5500 |
| s(PC1):LineageBTN2 | 0.0 | 0.00 | 0.4362 |
| s(PC2):LineageBTN1 | 1.1 | 8.89 | 0.0011 |
| s(PC2):LineageBTN2 | 0.0 | 0.00 | 0.9087 |
| s(OGP_sample):LineageBTN1 | 0.9 | 3.36 | 0.0335 |
| s(OGP_sample):LineageBTN2 | 0.0 | 0.00 | 0.7184 |
| s(Sample) | 0.9 | 8.20 | 0.0019 |
Визуализация значимых связей
Проверка предсказательной силы модели
Связь с ключевыми предикторами на данных 2021 г
Fetch
Связь с ключевыми предикторами на данных 2021 г
Расстояние до порта
Связь с ключевыми предикторами на данных 2021 г.
Положение относительно порта
Связь с ключевыми предикторами на данных 2021 г.
Положение относительно порта
